domingo, 26 de febrero de 2012


SEP                        SNEST                  DGEST



INSTITUTO TECNOLOGICO DE CIUDAD ALTAMIRANO


ALUMNA: Mariel Campos González.
 


N° de Control: 09930301
  

Lic. en Biología

Cd. Altamirano Gro.



TRANSPOSICION
La transposición, es la recombinación entre secuencias especificas y sitios de DNA inespecíficos. Los procesos biológicos promovidos por estas reacciones de recombinación comprenden la inserción de genomas víricos en el DNA de la célula huésped durante la infección, la inversión de segmentos de DNA para alterar la estructura génica y el movimiento de los elementos transponibles con frecuencia llamados genes “saltarines” de un sitio de cromosomas a otro.
La transposición es la causa principal de mutación espontaneas casi la mitad del genoma humano presenta secuencias derivadas de elementos transponibles. La infección vírica como el desarrollo del sistema inmune de los vertebrados dependen de estos reordenamientos especializados del DNA. La recombinación especifica de sitio conservadora y la transposición comparten características mecanicistas fundamentales. Proteínas llamadas recombinasas reconocen las secuencias especificas donde se producirá la recombinación dentro de una molécula de DNA. Las recombinasas acercan estos sitios específicos para formar un complejosi ps DNA- proteína que vincula los sitios de DNA y recibe el nombre de complejo sináptico. Dentro de este la recombinasa cataliza el corte y el resellado de las moléculas de DNA, ya sea para invertir un segmento del DNA o mover un segmento hacia un sitio nuevo.  Una sola proteína recombinasa suele tener a su cargo la realización de todos estos pasos. Ambos tipos de recombinación están muy bien controlados, de modo que para la célula se reduzca al mínimo el peligro de que se produzcan roturas del DNA y reordenamientos de sus segmentos.

Los transposones son elementos genéticos móviles que difieren de los plásmidos y de los virus en varios aspectos:
  1. llevan un gen para la enzimas transposasa, que cataliza su integración al cromosoma del hospedador;
  2. en cada extremo del transposón hay una secuencia repetida directa o invertida;
  3. la secuencia blanco en el cromosoma hospedador se duplica cuando se inserta el transposón y el resultado es que el transposón queda flanqueado en cada extremo por la secuencia blanco.
Los transposones pueden causar mutaciones, interfiriendo con la expresión normal de los genes de la célula hospedadora. Los transposones simples contienen solamente genes implicados en su transposición; los compuestos llevan genes estructurales adicionales.

a).-La secuencia de nucleótidos en la cual ocurre la inserción se conoce como sitio blanco.
 
b).-Se producen cortes escalonados en el sitio blanco y

c).-el transposón se une a los extremos que sobresalen de los cortes.

d).-Cuando los espacios se completan por síntesis de la hebra complementaria, se forman repeticiones idénticas en ambos lados del transposón insertado. Éstos, a menudo, se usan como "mojones" para identificar las secuencias de DNA que han sido transpuestas.

 Bibliografia Citada:

SEP                        SNEST                  DGEST



INSTITUTO TECNOLOGICO DE CIUDAD ALTAMIRANO


ALUMNA: Mariel Campos González.



N° de Control: 09930301

Lic. en Biología

Cd. Altamirano Gro.


 
UNIDAD III
OBJETIVO:

  • Comprender la forma en que esta organizado el genoma de los organismos para entender su funcionamiento.
  • Relacionar los distintos grados de empaquetamiento con las distintas etapas del ciclo celular.
  • Discutiremos las distintas maneras en que el ADN se organiza en cromosomas, incluyendo virus, bacterias y eucariotas.
    ORGANIZACION DEL MATERIAL GENETICO
    El material genético se compacta en un área discreta de la célula formando los cromosomas. Éstos se encuentran en los virus, células procariotas, en el núcleo de células eucariortas y en cloroplastos y mitocondrias.


     
    3.1 ORGANISMOS PROCARIOTICOS
    Los Organismos Procariotas, son aquellos seres cuya estructura celular se encuentra sin núcleo celular diferenciado, es decir, cuyo material genético se encuentra disperso en el citoplasma.y en su gran mayoría resisten condiciones ambientales sorprendentes por lo extremas en parámetros como la temperatura o la acidez.
    Los organismos Procariotas fueran posiblemente las primeras células simples que aparecieron al iniciar la vida en la tierra, hace miles de millones de años.

     
    Las bacterias son organismos procarióticos unicelulares, a veces formando colonias de muchas celulas. Las bacterias contribuyen substancialmente a la biomasa total de los ambientes marinos y, dado que los océanos cubren el 70% de la superficie del planeta, las bacterias representan una parte significativa de la biomasa total de la Tierra.
    • Poseen una membrana celular y una pared bacteriana.
    • Carecen de membrana nuclear.
    • Carecen de organulos.
    • Su tamaño es menor que las células eucariotas.




     La forma de las bacterias es diversa.
    Ejemplo:
    Coco (del griego kókkos, grano): de forma esférica.Diplococo: cocos en grupos de dos.
    Tetracoco: cocos en grupos de cuatro.
    Estreptococo: cocos en cadenas.
    Estafilococo:cocos en agrupaciones irregulares o en racimo.
    * Bacilo (del latín baculus, varilla): en forma de bastoncillo.

    * Formas helicoidales:
    Vibrio: ligeramente curvados y en forma de coma, judía o cacahuete.
    Espirilo: en forma helicoidal rígida o en forma de tirabuzón.
    Espiroqueta: en forma de tirabuzón (helicoidal flexible).



     

    martes, 21 de febrero de 2012



    SEP                        SNEST                  DGEST




    INSTITUTO TECNOLOGICO DE CIUDAD ALTAMIRANO




    ALUMNA: Mariel Campos González.
    N° de Control: 09930301

    Lic. en Biología




    Cd. Altamirano Gro.






    INDICE


                                                                                                             Pag.

    RESUMEN _____________________________________________3

    ABSTRACT ____________________________________________4

    ANTECEDENTES ______________________________________ 5, 6

    DEFINICIÓN DEL PROBLEMA _____________________________7

    OBJETIVO GENERAL ___________________________________ 8

    JUSTIFICACIÓN ________________________________________9

    FUNDAMENTO TEÓRICO ________________________________10

    MATERIALES Y MÉTODOS ______________________________ 11

    RESULTADOS _________________________________________12, 15

    CONCLUSIONES _______________________________________16

    FUENTES CONSULTADAS ________________________________17



    RESUMEN:

    El modelo de la Doble Hélice propuesto por Watson y Crick está basado en estudios del ADN. El ADN es muy grande, largo y delgado, esta  compuesta por nucleótidos que contienen las bases nitrogenadas Adenina, Timina, Citosina y Guanina. La doble hélice exige que cada una de las Bases Nitrogenadas de una cadena se aparee en forma complementaria con la base de la otra cadena. Este apareamiento tiene lugar mediante las uniones Puente de Hidrógeno que se forman entre las mismas. Entre las Bases Adenina y Timina se forman dos uniones Puente de Hidrógeno, mientras que entre la Guanina y la Citosina se establecen tres uniones de la misma naturaleza. La conformación que adquiere en el espacio dista de ello, ya que el mismo posee una estructura cerrada, constituyendo bucles. Esta estructura la adopta ya que le son agregadas fuerzas adicionales que lo mantienen empaquetado. Si además del giro que presenta le agregamos otro giro alrededor de su eje, obtendremos una idea más acertada de su verdadera conformación, y a este giro adicional, con el que se encuentra dispuesto en el espacio, se lo denomina Superenrollamiento.




    ABSTRACT


    The model of the double helix by Watson and Crick proposed is based on DNA studies. DNA is very large, long and thin, is composed of nucleotides containing the nitrogenous bases adenine, thymine, cytosine and guanine. The double helix requires that each of the nitrogenous bases of one chain to mate in complementary fashion with the base of the other strand. This mating occurs through the hydrogen bridge bonds are formed between them. Among the bases adenine and thymine form two hydrogen bridge bonds, whereas between the guanine and cytosine are three joints of the same nature. Conformation that acquires in space far from it, since it has a closed structure, forming loops. This structure is adopted and which are added additional forces that keep packaging. If in addition we added twist that presents another rotation around its axis, we get a better idea of its true shape, and this additional money, with which it is arranged in space, is called supercoiling.


    ANTECEDENTES:

    Miescher en 1871 aisló del núcleo de las células de pus una sustancia ácida rica en fósforo que llamó "nucleína". Un año más tarde, en 1872, aisló de la cabeza de los espermas del salmón un compuesto que denominó "protamina" y que resultó ser una sustancia ácida y otra básica. El nombre de ácido nucleico procede del de "nucleína" propuesto por Miescher.

    Una vez demostrado que los ácidos nucleicos eran los portadores de la información genética, se realizaron muchos esfuerzos encaminados a determinar su estructura con exactitud. Watson y Crick (1953) fueron los primeros investigadores en proponer una estructura para los ácidos nucleicos y su labor investigadora se vio recompensada con el Premio Nobel en 1962, Premio Nobel que compartieron con M. H. F. Wilkins y que se les concedió por sus descubrimientos en relación con la estructura molecular de los ácidos nucleicos y su significación para la transmisión de la información en la materia viva. Para realizar su trabajo emplearon dos tipos de datos ya existentes.

    Uutilizaron los datos obtenidos varios años antes por Chargaff (1950), relativos a la composición de bases nitrogenadas en el ADN de diferentes organismos.

    El otro tipo de datos eran los procedentes de estudios de difracción de rayos X sobre fibras de ADN. Para determinar la estructura tridimensional o disposición espacial de las moléculas de ADN, se hace incidir un haz de rayos X sobre fibras de ADN y se recoge la difracción de los rayos sobre una película fotográfica. La película se impresiona en aquellos puntos donde inciden los rayos X, produciendo al revelarse manchas. El ángulo de difracción presentado por cada una de las manchas en la película suministra información sobre la posición en la molécula de ADN de cada átomo o grupo de átomos.

    Mediante esta técnica de difracción de rayos X se obtuvieron los siguientes resultados:

    Las bases púricas y pirimidínicas se encuentran unas sobre otras, apiladas a lo largo del eje del polinucleótido a una distancia de 3,4. Las bases son estructuras planas orientadas de forma perpendicular al eje (Astbury, 1947).

    El diámetro del polinucleótido es de 20  y está enrollado helicoidalmente alrededor de su eje. Cada 34  se produce una vuelta completa de la hélice.

    Existe más de una cadena polinucleotídica enrollada helicoidalmente (Wilkins et el. 1953, Frankling y Gosling, 1953).

    Basándose en estos dos tipos de datos Watson y Crick propusieron su Modelo de estructura para el ADN conocido con el nombre de Modelo de la Doble Hélice. Las características del Modelo de la Doble Hélice son las siguientes:

    El ADN es una doble hélice enrollada helicoidalmente “a derechas” (sentido dextrorso). Algo parecido a dos muelles entrelazados.

    Enrollamiento de tipo plectonémico: para separar las dos hélices es necesario girarlas como si fuera un sacacorchos.

    Cada hélice es una serie de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiéster en los que un grupo fosfato forma un puente entre grupos OH de dos azúcares sucesivos (posiciones 3’ de un azúcar y 5’ del siguiente).

    Las dos hélices se mantienen unidas mediante puentes o enlaces de hidrogeno producidos entre las bases nitrogenadas de cada hélice. Siguiendo los datos de Chargaff (1959), la Adenina de una hélice aparea con la Timina de la hélice complementaria mediante dos puentes de hidrógeno. Igualmente, la Guanina de una hélice aparea con la Citosina de la complementaria mediante tres puentes de hidrógeno.


    DEFINICION DEL PROBLEMA:

    Estudiaremos las diferentes formas que tiene el DNA, para saber como actúan y como es que ayudan a que el material genético se guarde, y tener mas conocimientos sobre esta materia para poder pasarla.



    OBJETIVO GENERAL:
    El objetivo Principal de este primer trabajo es que el estudiante adquiera familiaridad con la biología molecular, que descubra que además de la forma A, B y Z, existen muchas formas biológicas en las que podemos encontrar el DNA y las implicancias de esto para la expresión y la vida, también se busca que se usen los recursos web y las TIC´s.




    JUSTIFICACION:


    El modelo de la Doble Hélice propuesto por Watson y Crick está basado en estudios del ADN en disolución (hidratado). La denominada forma B ó ADN-B tiene un mayor interés biológico ya que es la que presenta el ADN en interacción con las proteínas nucleares. Además de la forma B, existen otras estructuras posibles que puede presentar el ADN.



    FUNDAMENTO TEORICO:

    ADN-B: ADN en disolución, 92% de humedad relativa, se encuentra en soluciones con baja fuerza iónica se corresponde con el modelo de la Doble Hélice.

    ADN-A: ADN con 75% de humedad, requiere Na, K o Cs como contraiones, presenta 11 pares de bases por giro completo y 23 Å de diámetro. Es interesante por presentar una estructura parecida a la de los híbridos ADN-ARN y a las regiones de autoapareamiento ARN-ARN.

    ADN-Z: doble hélice sinistrorsa (enrollamiento a izquierdas), 12 pares de bases por giro completo, 18 Å de diámetro, se observa en segmentos de ADN con secuencia alternante de bases púricas y pirimidínicas (GCGCGC), debido a la conformación alternante de los residuos azúcar-fosfato sigue un curso en zig-zag. Requiere una concentración de cationes superior a la del ADN-B, y teniendo en cuenta que las proteínas que interaccionan con el ADN tienen gran cantidad de residuos básicos sería posible que algunas convirtieran segmentos de ADN-B en ADN-Z. Las posiciones N7 y C8 de la Guanina son más accesibles.


    MATERIAL Y METODOS:

    Esta investigación se llevo a cabo para conocer las formas del ADN, en fuentes de internet y consultando con algunos maestros de la institución.



    RESULTADOS:

    ADN con enrollamiento paranémico: Las dos hélices se pueden separar por traslación, cada hélice tiene segmentos alternantes dextrorsos y sinistrorsos de unas cinco bases. Uno de los principales problemas del modelo de la doble hélice (ADN-B) es el enrollamiento plectonémico, para separar las dos hélices es necesario girarlas como un sacacorchos, siendo necesario un gran aporte energético.


    ADN cuádruplex: "In vitro" se han obtenido cuartetos de Guanina (ADN cuádruplex) unidas mediante enlaces tipo Hoogsteen, empleando polinucleótidos que solamente contienen Guanina (G). Los extremos de los cromosomas eucarióticos (telómeros) tienen una estructura especial con un extremo 3' OH de cadena sencilla (monocatenario) en el que se repite muchas veces en tándem una secuencia rica en Guaninas. Se piensa que el ADN cuádruplex telomérico serviría para proteger los extremos cromosómicos de la degradación enzimática.



     
    ADN-C: ADN con 66% de humedad, se obtiene en presencia de iones Li, muestra 9+1/3 pares de bases por giro completo y 19 Å de diámetro.De cadena sencilla. Se sintetiza a partir de una hebra simple de ARNm maduro. Se suele utilizar para la clonación de genes propios de células eucariotas en células procariotas, debido a que, dada la naturaleza de su síntesis, carece de intrones.
    ADN triple hélice o ADN-H: "In vitro" es posible obtener tramos de triple hélice intercalando oligonucleótidos cortos constituidos solamente por pirimidinas (timinas y citosinas) en el surco mayor de una doble hélice. Este oligonucleótido se une a pares de bases A-T y G-C mediante enlaces de hidrógeno tipo Hoogsteen que se establecen entre la T o la C del oligonucleótido y los pares A-T y G-C de la doble hélice. No se sabe la función biológica del ADN-H aunque se ha detectado en cromosomas eucarióticos.


    ADN curvado: las secuencias de ADN con segmentos de 4 a 6 Adeninas separados a intervalos regulares de 10 bases producen conformaciones curvadas astas curvas son al parecer, un elemento fundamental para que esta molécula pueda interaccionar con proteinas que catalizan procesos tan importantes como la replicación, transcripción y la recombinación.
    ADN cruciforme: son estructuras cruciformes. Las repeticiones (palíndromos) invertidas (o especulares) de segmentos de polipurinas/polipirimidinas también pueden formas estructuras cruciformes o en horquilla mediante la formación de emparejamientos intracatenarios.

    ADN nódulo: consiste en dos pares de triples hélices intermoleculares.
    ADN dislocado: esta estructura se forma mediante el desenrroscamiento de la doble hélice y el posterior apareamiento de una copia de la repetición directa con la copia adyacente en la otra cadena.


    CONCLUSIONES:
    Todas las formas de ADN que encontramos son antiparalelas, delgadas y alargadas.

    FUENTES CONSULTADAS:

    lunes, 20 de febrero de 2012

    II UNIDAD

    "ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DEL MATERIAL GENÉTICO"




     La estructura de la DNA, es una doble  hélice integrada por el antiparaelo dos y los filamentos elogiosos del ácido deoxiribonucleico. Cada base nitrogenada ata através del hidrógeno que enlaza a una base nitrogenada complementaria (Adenina a Timina, y Citosina a Guanina y viceversa). 
    El  DNA tiene una estructura secundaria significativa. Cada hé´lice doble de la DNA consiste en cadenas quimicamente ligadas de nucleotides. Cada nucleotide en la DNAconsiste en azúcar, un grupo del fosfato, y un nucleobase o base. El DNA se compone de subunidades múltiples de nucleotidos, el DNA es tambien un polimero de nucleotidos. Las unidades del azucar forman la pieza de la espina dorsal externa polar hidrofilica del azucar-fosfato.Los nucleotidos forman una base hidrofobica de bases: Adenina, Timina, Guanina y Citosina.




    La espina dorsal del Azucar-Fosfato de la DNA 

    El DNA se puede dividir estructuralmente en dos porciones: La espina dorsal externa del azucar-fosfato, y las bases internas del nucleotide. La espina dorsal del azucar- fosfato es el componente estructural principal de la molécula del DNA. La espina dorsal se compone de las moléculas del azucar del desoxy-ribosa que se alternan y las moléculas del  del fosfato son altamente polares. La espina dorsal es hidrofilica debido a su polaridad.




    ´El DNA se compone de 4 bases nitrogenadas:Adenina, Guanina, Citosina y Timina. Estas bases son no polares. Dentro de una molecula del DNA estas bases se aparean formando los enlaces del hidrogeno que estabilizan la molécula del DNA., estas bases interiores se aparean y de este modo, se dice que la helice es elogiosa. A esto nos referimos como el codigo génetico. 


     PROPIEDADES:
     La macromolécula de ADN puede adoptar una forma lineal o una forma circular cerrada. Gran parte del ADN de las bacterias y de los virus, el ADN mitocondrial y el de los plásmidos, adoptan formas circulares. Aunque en general se acepta que el ADN nuclear de las células eucariotas (células de los seres superiores con núcleos bien definidos) se halla organizado en largas unidades de cadena abierta o lineal, una importante cantidad de datos experimentales tiende a modificar este concepto. En el núcleo en interfase (período entre dos divisiones celulares) gran parte de la fibrilla de cromatina se halla organizada en forma de múltiples bucles o asas. Los dos extremos de cada una de estas asas se unen a estructuras de la membrana nuclear denominadas complejos de poro nuclear y se comportan, por lo tanto, como una unidad circular cerrada. Dado que cada una de las asas contiene ADN, queda probado que el núcleo de la célula eucariota aloja múltiples unidades de ADN circular.
    El ADN circular puede encontrarse en forma relajada o en forma superenrollada. En la forma relajada, el círculo se halla desplegado sobre un único plano; en la forma superenrollada el contorno del círculo va girando sobre sí mismo de manera tal que adquiere profundidad (véase la figura 8).
    Las dos formas de ADN circular pueden visualizarse en el microscopio electrónico como círculos relajados o superenrollados. Además, pueden identificarse por electroforesis o por centrifugación (separación de partículas en suspensión coma ayuda de un campo eléctrico o de un campo gravitacional respectivamente). En estos casos, la estructura compactada del ADN superenrollado aumenta su migración electroforética y su velocidad de sedimentación, lo cual permite diferenciarlo del ADN circular relajado o del ADN lineal.
    Como casi todas las propiedades físicas, químicas y biológicas del ADN se vinculan al ADN circular y a su estado relajado o superenrollado, la clara definición de estas formas es importante para alcanzar una acabada comprensión de dichas propiedades.








    2.1 ESTRUCTURA FISICA Y QUIMICA DE LOS ACIDOS NUCLEICOS: AND Y ARN



    El ADN es un largo polímero formado por unidades repetitivas, losnucleótidos. Una doble cadena de ADN mide de 22 a 26 angstromos (2,2 a 2,6 nanómetros) de ancho, y una unidad (un nucleótido) mide 3,3 Å (0,33 nm) de largo. Aunque cada unidad individual que se repite es muy pequeña, los polímeros de ADN pueden ser moléculas enormes que contienen millones de nucleótidos. Por ejemplo, el cromosoma humano más largo, elcromosoma número 1, tiene aproximadamente 220 millones de pares de bases.

    AND PROPIEDADES QUIMICAS:
    • Azúcar, en concreto una pentosa.
    • Bases nitrogenadas: púricas y pirimidínicas.
    • Ácido fosfórico.



    • ADN PROPIEDADES FISICAS:
    • Doble helice
    • Antiparalela
    • Aproximadamente 10 nucleotidos por vuelta
    • Las cadenas se unen por puentes de hidrogeno
    • Es helicoidal
    • Es destrogida
    • Cadena 1 fosfodiester
    • ARN PROPIEDADES QUIMICAS:
    • Ribosa
    • Grupo fosfato
    • Bases nitrogenadas

     
    • ARN PROPIEDADES FISICAS:
    • Cadena sencilla
    • Forma lineal= ARNm
    • Forma globular=ARNr
    • Forma de trebol=ARNt




    CONCLUSIÓN:
    La estructura del ADN es una cadena de doble helice formada por nucleotidos como son, azúcar desoxirribosa, un grupo fosfato y las bases nitrogenadas (Adenina, Guanina, Citosina y Timina). El ADN tiene la capacidad para contener información con un lenguaje codificado en la secuencia de pares nucleótidos, se puede replicar dando origen a dos copias iguales y tiene la capacidad de mutacion justificando los cambios evolutivos, almacena toda la informacion genetica que se transmite de generacion en generacion.